Prinzipiell geht es in der Physik nicht darum die Gesamtenergie, sondern die potentielle Energie von Systemen zu minimieren, was aus der Minimierung der Wirkung folgt. Auch sind Systeme erst dann stabil, wenn sie sich in einem Potentialminimum befinden.
Die Energieerhaltung ist eines der grundlegendsten Prinzipien des uns bekannten Universums. Es geht also keine Energie verloren. Wenn nun Energie aufgewendet werden muss, um eine Potentialbarriere zu überwinden, dann befindet sich das System in einem energetisch neuen Umfeld, das wieder einen energetisch anderen Grundzustand haben kann.
Man könnte dann noch erwähnen, dass es andere physikalische Größen gibt, die eine Reversion des Prozesses verbieten, falls explizit danach gefragt wird.